Eu costumava setar as minhas variáveis de ambiente no /etc/profile, mas aprendi que não é uma boa prática seta-las em scripts de nível de sistema, como por exemplo /etc/profile ou ~/.bash_profile dentre outros.
Resumindo a história, o mais correto é usar o /etc/enviroment
Há uma explicação completa sobre isso em
https://help.ubuntu.com/community/EnvironmentVariables
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